Pokretanje Apple Watch Series 1 i 2 predstavljalo je važnu promjenu u autonomiji ovih uređaja, prelazeći iz jednog u dva dana koja nam je Series 2 ponudio, sve dok nismo intenzivno koristili GPS i bilo kakvu fizičku aktivnost. No, lansiranjem Serije 3, konkretno modela s LTE vezom, autonomija je još jednom svedena na ono što nam je originalni Apple Watch ponudio: 18 sati. Međutim, model bez podatkovne veze i dalje nam nudi dva dana autonomije poput svog prethodnika, serije 2, modela koji je povučen s tržišta.
Ali ovih 18 sati može se znatno smanjiti ako koristimo GPS i telefonske pozive. Prema Appleu, uz autonomiju Series 3 možemo: 90 puta provjerite imamo li obavještenja, koristite aplikacije 45 minuta, izvodite vježbanje 30 minuta dok slušate muziku. Omogućuje nam i pozivanje sat vremena sa samog uređaja ili tri sata ako to radimo putem svog iPhonea. Iako ga Apple nije odredio, pretpostavlja se da će se LTE čip u Apple Watchu automatski isključiti kada je povezan s iPhoneom, kako bi se produžio vijek trajanja baterije i ne bi primala obavještenja i pozive na oba uređaja.
Serija 3 omogućava nam izvođenje vježbi 10 sati. Ali ako nastavimo trčati s aktiviranim GPS-om, autonomija je smanjena na 4 sati. Vrijeme punjenja 80% baterije Apple Watch Series 3 je sat i pol s originalnim punjačem, ali ako želimo da bude pun, morat ćemo pričekati dva sata. Model s LTE vezom trenutno nije dostupan za rezervacije u Španiji, što bi moglo ukazivati na to da sami operateri moraju ponuditi rješenje za povezivanje korisniku. U Sjedinjenim Državama operatori nude dodatni plan podataka za određeni model po cijeni od 10 USD mjesečno.