Parece que existem alguns problemas de exibição de PDFs no macOS Sierra 10.12.2 E não é um problema que volte a acontecer, é uma falha que está localizada no sistema operacional da Apple há muito tempo e que parece não ter sido resolvida. A Apple lança constantemente atualizações para seus sistemas operacionais, mas há detalhes como neste caso do gerenciamento de arquivos PDF que não parecem encontrar uma solução nessas novas atualizações.
Este é o caso da Fujitsu e seus usuários do ScanScap com um bug no manuseio de PDF no scanner resolvido como problema de PDFKit no macOS 10.12 ou problemas encontrados pelo Christian Grunenberg, desenvolvedor do DEVONthink, que alertam sobre problemas com documentos neste formato PDF. Parece que a compatibilidade que Cupertino quer dar com o framework iOS e macOS, estaria causando alguns problemas. Além disso, o próprio Adam C. Engst em TidBITS nos avisa em este artigo sobre isso.
Agora coautor de Take Control of Preview, Adam Engst explica que é verdade que a Apple adicionou uma solução para o problema na versão anterior à atual 10.12.1, mas agora problemas com PDF e visualização reaparecem na versão atual:
Devo aconselhar os usuários do macOS Sierra a evitar o uso do Preview para editar documentos PDF até que a Apple conserte essas falhas. Se a edição de um PDF na visualização for inevitável, certifique-se de trabalhar apenas em uma cópia do arquivo e mantenha o PDF original.
É possível que, se você puder ler um documento PDF sem problemas na visualização, mas no momento em que tiver que editá-lo, ele poderá "Crash" automaticamente e torna o documento inutilizável para outros aplicativos, Por esse motivo, aconselhamos manter uma cópia do documento original e não perder tudo ou usar um aplicativo de terceiros que utilize suas próprias bibliotecas de PDF para essas edições, já que hoje são a opção mais segura.